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使用蛋白质组和小 RNA 数据预测人血浆年龄:比较分析

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一篇题为“利用卵白质组学和小RNA数据进行人类血浆春秋展望:比力阐发”的新研究论文已颁发在《Aging》杂志上。

基于综合份子数据构建的朽迈时钟已成为医学、法医学和生态研究范畴有远景的东西。但是,很少有研究比力分歧份子数据类型展望统一队列中春秋的合用性,和将它们连系起来是不是会改良展望。在这项新研究中,加文新南威尔士年夜学卡罗林斯卡学院的研究职员 Jérôme Salignon、Omid R. Faridani、Tasso Miliotis、Georges E. Janssens、Ping Chen、Bader Zarrouki、Rickard Sandberg、Pia Davidsson 和 Christian G. Riedel医学研究所和阿斯利康在 103 份人类血浆样本中的卵白质和小 RNA 程度上对此进行了摸索。

研究小组写道:“在这里,我们扩年夜了按照统一队列的分歧类型份子数据构建的朽迈时钟之间有限的比力组合。”

起首,研究职员利用两步质谱法丈量 612 种卵白质,选择并量化品貌随春秋转变的 21 种卵白质。值得注重的是,跟着春秋的增加,补系统统成份的卵白质含量也随之增添。接下来,他们利用小 RNA 测序来选择和量化一组 315 个小 RNA,这些小 RNA 的品貌跟着春秋的增加而转变。此中年夜部门是细小RNA (miRNA),跟着春秋的增加而下调,并展望其方针基因与发展、癌症和朽迈相干。最后,该团队操纵搜集到的数据成立了春秋展望模子。

在分歧类型的份子中,卵白质发生的模子最精确(R² = 0.59 ± 0.02),其次是 miRNA,是表示最好的小 RNA 种别(R² = 0.54 ± 0.02)。有趣的是,卵白质和 miRNA 数据的连系利用改良了展望 (R² = 0.70 ± 0.01)。将来的工作将需要利用更年夜的样本量和验证数据集来确认这些成果。

研究职员总结道:“虽然如斯,我们的研究表白,连系卵白质组和 miRNA 数据可以发生更好的春秋展望,这多是经由过程捕捉更普遍的与春秋相干的心理转变来实现的。肯定连系分歧份子数据类型是不是可以作为一种通用的方式将很有趣。”改良将来老化时钟的策略。”

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